Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms