Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHQ0

Fbxo4, F-box only protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo4Q8CHQ0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo4Q8CHQ0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo4Q8CHQ0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo4Q8CHQ0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo4Q8CHQ0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo4Q8CHQ0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo4Q8CHQ0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo4Q8CHQ0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo4Q8CHQ0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo4Q8CHQ0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo4Q8CHQ0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo4Q8CHQ0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo4Q8CHQ0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo4Q8CHQ0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo4Q8CHQ0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo4Q8CHQ0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo4Q8CHQ0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo4Q8CHQ0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms