Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Upp2Q8CGR7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms