Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms