Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nhlrc3Q8CCH2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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