Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc60Q8C4J0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc60Q8C4J0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms