Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc90bQ8C3X2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms