Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg16l1Q8C0J2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg16l1Q8C0J2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms