Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms