Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms