Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWU1

Sprn, Shadow of prion protein, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprnQ8BWU1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SprnQ8BWU1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms