Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms