Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zcchc4Q8BKW4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms