Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc2Q8BKV1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms