Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms