Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prox2Q8BII1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prox2Q8BII1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms