Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Vipas39Q8BGQ1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Vipas39Q8BGQ1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Vipas39Q8BGQ1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vipas39Q8BGQ1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Vipas39Q8BGQ1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Vipas39Q8BGQ1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Vipas39Q8BGQ1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Vipas39Q8BGQ1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms