Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms