Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms