Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z96

Vangl1, Vang-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vangl1Q80Z96 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vangl1Q80Z96 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vangl1Q80Z96 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vangl1Q80Z96 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vangl1Q80Z96 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vangl1Q80Z96 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vangl1Q80Z96 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vangl1Q80Z96 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vangl1Q80Z96 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vangl1Q80Z96 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vangl1Q80Z96 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vangl1Q80Z96 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vangl1Q80Z96 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms