Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap100Q80VN0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap100Q80VN0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms