Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc155Q80VJ8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms