Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms