Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rims3Q80U57 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rims3Q80U57 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms