Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Arhgef17Q80U35 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Arhgef17Q80U35 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Arhgef17Q80U35 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Arhgef17Q80U35 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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