Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cul9Q80TT8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cul9Q80TT8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms