Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl29Q80T74 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl29Q80T74 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms