Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf7ipQ7TT18 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms