Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms