Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IfnkQ7TSL0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms