Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf516Q7TSH3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms