Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek5Q7TSC3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms