Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Actn1Q7TPR4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Actn1Q7TPR4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms