Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Stk40Q7TNL3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stk40Q7TNL3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stk40Q7TNL3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Stk40Q7TNL3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stk40Q7TNL3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stk40Q7TNL3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stk40Q7TNL3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stk40Q7TNL3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stk40Q7TNL3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stk40Q7TNL3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Stk40Q7TNL3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stk40Q7TNL3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stk40Q7TNL3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stk40Q7TNL3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stk40Q7TNL3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stk40Q7TNL3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stk40Q7TNL3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stk40Q7TNL3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms