Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp397Q7TNK4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms