Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp3Q7TNH6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp3Q7TNH6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms