Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms