Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf2Q7TMI3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms