Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY3

Rps27l, 40S ribosomal protein S27-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27lQ6ZWY3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps27lQ6ZWY3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms