Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rps27Q6ZWU9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms