Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms