Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Efr3bQ6ZQ18 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Efr3bQ6ZQ18 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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Efr3bQ6ZQ18 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Efr3bQ6ZQ18 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efr3bQ6ZQ18 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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