Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinlQ6ZQ12 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NinlQ6ZQ12 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
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