Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc44a1Q6X893 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc44a1Q6X893 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms