Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rhox8Q6VSS7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rhox8Q6VSS7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Rhox8Q6VSS7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rhox8Q6VSS7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rhox8Q6VSS7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rhox8Q6VSS7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rhox8Q6VSS7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rhox8Q6VSS7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rhox8Q6VSS7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rhox8Q6VSS7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rhox8Q6VSS7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rhox8Q6VSS7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rhox8Q6VSS7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Rhox8Q6VSS7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rhox8Q6VSS7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rhox8Q6VSS7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rhox8Q6VSS7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms