Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms