Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJE0

Gfral, GDNF family receptor alpha-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GfralQ6SJE0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GfralQ6SJE0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GfralQ6SJE0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms