Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gja6Q6S5G4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms