Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrn2Q6PHP6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrn2Q6PHP6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms