Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Tmeff1Q6PFE7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms